2014-04-01から1ヶ月間の記事一覧

SRA Toolkit

自分が利用したオプションのメモ。 あくまで自分が利用した範囲にとどまるので、一般的な使い方は他をあたった方が無難だと思われる。1. fastq-dumpを用いたsraからfastqへの変換"--spot-group" or "-G" バーコード付きの配列が1つのsraファイルに混在してい…

ある確率変数に対する複数のガウス分布の積

独立な確率変数に対するガウス分布の積は見かけるが、特定の確率変数に対しガウス分布が複数存在する場合の計算を発見できなかったのでまとめてみた。動的計画法の計算過程で必要となったが、一般的な確率モデルで必要となることはなさそう?ある確率変数に…

memory-less propertyと指数分布のゆるくない関係

時間を経ても次の起こりやすさが変化しないという性質は、無記憶性(memory-less property, loss of memory property)と呼ばれる。ここである時刻までにある現象が起きる確率の累積分布関数を考えたとき、それが無記憶性を持つとは以下の式が成り立つ場合で…

「ゆるふわ」とは

「ゆるふわ」とは、緩りとふわりとしている様を指す[1]。 ここで「緩り」を制約が緩いことと捉え、「ふわり」をふわふわ漂流していること、すなわちドリフトと捉えると、「ゆるふわ」とはつまり「ドリフト項付きブラウン運動」なのではないかと私は考えてい…